En las primeras decadas del siglo xix, la comunidad científica se estaba convenciendo de que todos los seres vivos están formados por células y que éstas son la unidad básica de la vida.
Las observaciones en el microscopio se hacían colocando simplemente la muestra bajo el objetivo de este instrumento, pero, en 1858, se introdujo una técnica que signifi có un gran paso en el estudio de las células: se comenzaron a usar colorantes que se impregnaban en unas estructuras de las células y en otras no, con ello se logró diferenciarlas. Como ejemplo,a la izquierda se ve una imagen de células sin colorante y, a la derecha,células semejantes con colorante en las cuales se distingue, con facilidad,una estructura redonda y oscura: el núcleo.
Se han desarrollado nuevos microscopios ópticos mediante el uso de lentes de mayor calidad y aprovechando los avances en tecnologia, como el microscopio electrónico. De igual forma, se han mejorado las técnicas de tinción y diferenciación.Esto ha posibilitado que se conozca con mayor profundidad el funcionamiento de las estructuras de las células y hasta los virus.
En la actualidad, se siguen diseñando nuevos métodos de estudio para conocer nuevos microorganismos.
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En 1932, se inventó el microscopio electrónico y, con el paso del tiempo,ha ido evolucionando. Con él, se han logrado observar detalladamente bacterias, estructuras internas de las células y hasta virus. Estos últimos no son considerados seres vivos.
